De maag darmreflex is een voorbeeld van het signaal dat de hersenen geven aan onze systemen en stelsels. Zodra je iets eet begint je maag te werken. De maag kneedt het voedsel en zorgt dat het voedsel wordt omgezet in voedselbrij door toevoeging van maagzuur en maagsap. De enzymen in het maagsap breken het voedsel af waarna het na een tot twee uur naar de 12-vingerige darm wordt gestuurd. Deze verwerking gebeurt in kleine porties. Door het maagzuur zijn de meeste bacteriën gedood voor het voedsel de 12-vingerige darm bereikt. Borst- en flesvoeding zijn licht verteerbaar en vloeibaar daarom werkt de maag darmreflex bij baby’s veel sneller.
Op het moment dat je maag gevuld is na een maaltijd krijg de dikke darm het signaal dat er afvalstoffen onderweg zijn. De dikke darm doet gemiddeld acht en veertig uur over de verwerking van voedsel. Als het signaal arriveert moeten er dus nog oude afvalstoffen verwerkt worden om plaats te maken voor de nieuwe. Deze samenwerking tussen de maag en de dikke darm wordt de maag darmreflex genoemd. In de medische wereld spreekt men over de gastrocolische reflex. Komen er bacteriën via de mond in de maag dan kan de maagwand aangetast worden, er ontstaat een ontsteking waardoor de maag minder sappen kan maken. Het gevolg is in de meeste gevallen diarree. Ook kan een virus op deze manier diarree veroorzaken. De maag darmreflectie veroorzaakt darmkrampen, de ontlasting is dan waterig. Belangrijk bij diarree is het zelf aanvullen van vocht.